Les Franciscains évangélisèrent  Milpa Alta et construisent un couvent au XVIème siècle ainsi la ville a été rebaptisée San Pedro. Dans le grand portique pavé se réunissait la population locale autochtone pour l’évangélisation. L’ancien couvent est souligné par ses couloirs d’arches monumentaux et ses finitions de pierre volcanique rose.  La construction a commencé en 1570 et fut déclarée monument historique en 1933.

Actuellement il fait partie du circuit touristique de la délégation Milpa Alta grâce à sa beauté architecturale.