Le cimetière a été fondé en 1660 par le chanoine Juan María García Quintana, Chevalier de l'Ordre de Guadalupe, mais non confirmé par d'autres historiens qui  suggèrent qu'il a été fondé au XVIIIème siècle. Il fait partie du complexe religieux de la Villa de Guadalupe.

Dans ce cimetière reposent les restes Antonio López de Santa Anna, Xavier Villaurrutia, Ernesto Elorduy, Ponciano Díaz, Filomeno Mata et même, disons, San Juan Diego. Les monuments funéraires se distinguent par leurs styles gothiques, d’art nouveau, d’art déco et de romantisme.

En raison de sa valeur historique, architectural et culturel c’est aujourd'hui un musée où que l’on peut visiter sur rendez-vous. Il se compose de deux salles, la première traite de l'histoire la Colline du Tepeyac dès mexicas jusqu’à notre époque actuelle; le second renseigne sur l'histoire du cimetière.