Le MHNCA est un complexe architectural composé de dix grandes structures hémisphériques avec une superficie totale de 7 500 mètres carrés d'exposition. La répartition des 2 775 copies ont été faites à partir de 3 modules:

Module de 2 coupoles: L’Univers, Observatoire du Changement climatique et la Salle d’expositions temporaires.

Module de 4 coupoles : Evolution de la vie, Adaptation au milieu, Origine et Classification des êtres vivants.

Module 3 Voûtes: Evolution humaine et Biogéographie.

En outre, le musée dispose d'un hall et d’espaces verts qui permettent de réaliser des activités d’éducation environnementale et de divulgation scientifique.

Bien que depuis 1999, la construction ait commencé, ce ne fut que des années plus tard quand il se consolida comme le Musée d'Histoire Naturelle et de la Culture de l'environnement de la Ville de Mexico. Maintenant, il propose des visites guidées à des groupes qui sont enseignées par des biologistes et du personnel spécialisé par le musée et sont adaptées pour les enfants et adultes.

C’est important de souligner que la Collection nationale des insectes se compose d'environ 55 000 exemplaires, et peut être visité sur rendez-vous.