El Museo de Anatomía está bajo la dirección de la Facultad de Medicina de la UNAM y actualmente cuenta con 550 modelos, entre los que destaca uno del sistema inmunológico. Muchas de las piezas que se exhiben datan del siglo antepasado, lo que ayuda a reconocer la evolución de la ciencia médica en relación con el cuerpo humano. 

Cuenta con una colección aproximada de mil modelos de partes y órganos humanos naturales y reproducciones en plástico; con dibujos y esquemas elaborados en distintas técnicas plásticas, así como modelos naturales de partes anatómicas de algunos animales como tiburones, caballos, ratas, monos araña, gorilas, gacelas, cocodrilos, ranas, vacas y armadillos. Complementa su acervo con más de 30 mil diapositivas.

El recinto está abierto a todo el público que guste conocer más sobre el tema y se ubica en el interior de la Facultad de Medicina en Ciudad Universitaria, cerca de más museos y cultura.